常州市中医医院肿瘤科是江苏省级重点中医专科、国家中医药管理局“十二五”重点专科建设单位，南京中医药大学附属医院、南京中医药大学中西医结合肿瘤学硕士点。科室运用中医中药为主治疗肿瘤的同时，积极开展高能聚焦超声、化疗、介入、生物靶向及免疫等多种疗法，将多手段、多途径、多方法的综合治疗贯穿于肿瘤治疗的全过程。并有长期临床经验结晶而成的有效抗肿瘤协定处方，在治疗肿瘤，防治术后复发与转移，延长患者生存期、提高生活质量等方面发挥了重要的作用。

我院肛肠科自中医院痔科筹建发展而来，已有近60余年历史。积历任领导和科室全体新老同志的不懈努力，1996年成为院中医肛肠重点专科；1998年成为市重点专科建设单位；2002年成为市中医肛肠重点专科，2016年成为省中医肛肠重点专科。

常州市中医医院脑病科是江苏省中医临床重点专科，中国卒中联盟成员单位，开设有中风、眩晕、头痛、失眠等专病门诊，开放床位59张。学科已经形成一支高学历、结构合理、富有活力的技术团队。

常州市中医院肾病科由江苏省名中医、张氏肾病创始人张志坚教授创建于1987年，现为江苏省中医重点临床专科，常州市中医重点临床专科，常州市慢性肾衰中医临床诊疗中心，江苏省中医学会肾病专业委员副主任委员单位，苏南慢性肾脏病联盟成员单位。

常州中医医院产科是“江苏省中医重点专科”，“常州市中医重点专科”，南京中医药大学硕士研究生培养点，连续多年被评为“先进集体”、“医德医风先进科室”，“江苏省用户满意服务班组”。

常州市中医医院脾胃病科创建于1976年，1997年被评为常州市重点专科，2011年成功创建为江苏省中医重点专科。